東正教主張聖靈只來自聖父，天主教則主張聖靈來自聖父和聖子。東正教沒有關於『天堂』和『地獄』之間存在「煉獄」的說法，而天主教聲稱兩者之間有煉獄。東正教否認貞女瑪利亞貞節受孕及其肉體升天的教理，而天主教承認。東正教不承認羅馬教皇為普世教會首腦，只承認他的主教和「西部教會牧首」的職位，而天主教教皇自稱是全世界教會的領袖。

在神學方面

東正教沒有什麼革新和發展，較保守、缺乏活力，天主教則面向社會，面向世界，面向未來，它在世界許多地區開展的活動較有生氣，主張社會開放、自由、平等，提出諸多進步神學，像解放神學、婦女神學、黑人神學、希望神學、民眾神學、發展神學等。

服裝：

東正教教士衣著打扮與天主教教士不同，東正教主教頭戴圓頂帽，身穿銀白色或黑色神袍，胸掛聖像，手持權杖，而天主教主教頭戴桃形尖頂帽，身穿特制黃色神袍，胸掛十字架，手戴權戒。

語言：

舉行儀式時，東正教除了可使用希臘語外，還可使用地方民族語言，天主教則在長時期內只使用拉丁語，但有些天主教教會也可以使用地方民族語言。

唱聖歌：

唱聖歌時，東正教唱詩班沒有風琴伴奏，而天主教唱詩班則有；祈禱時，東正教徒用三個手指﹝拇指、食指和中指﹞在胸前自上向下，自右向左畫十字，而天主教徒用整個手掌在胸前自上向下，自左向右畫十字。

受洗：

受洗時，東正教採浸水式，天主教則採注水式。東正教主張嬰兒受洗後就有資格領聖餐，天主教則持反對意見。東正教的堅振禮在小孩﹝七歲前﹞受洗不久舉行，天主教的堅振禮在小孩長到七歲到八歲時進行；舉行聖餐禮時，東正教使用發酵麵包和酒，天主教使用無酵麵包，並規定，只有神職人員才能使用麵包和酒，一般教徒只能使用麵包。

禮拜：

禮拜時，東正教堂裡不擺坐椅，參加者只能站立，而天主教堂裡放有成排的長板凳，供祈禱者跪坐。

懺悔：

懺悔時，東正教規定，教徒在神父面前可站、可跪；天主教則規定，教徒在神父面前只能跪著。

婚姻：

婚姻方面，東正教允許除主教以外的一切神職人員結婚，在婚姻問題上比較自由，而天主教則很嚴格，一切神職人員都不得結婚，強調獨身主義和禁慾主義。

東正教的一些大節日與天主教的大至相同，只是稱謂不同。

基督教會的最初神品只有副助祭、助祭、司祭三個品位。基督教分裂後，東正教會實行牧首制，牧首制確立後，神品分黑白兩種：黑神品有修士、修士輔祭、修士大輔祭、修士祭司、修士大祭司、主教、大主教、督主教﹝牧首派駐國外教區代表﹞、都主教、牧首；白神品有誦經士、副輔祭、輔祭、大輔祭、司祭、大司祭、司祭長等，天主教會神品分為七品：司門員﹝一品﹞、誦經員﹝二品﹞、驅魔員﹝三品﹞、襄禮員﹝四品﹞、副助祭﹝五品﹞、助祭﹝六品﹞和主教﹝七品﹞。羅馬教廷制進一步發展後，主教品位又分為教皇、樞機主教﹝紅衣主教﹞、宗主教、大主教和一般主教。 

東正教使用儒略曆法，是現在公曆的前身，即舊曆。羅馬教皇格列高利十三世對舊曆進行改革，於1582年公布新曆法，稱格列曆法，自那時起天主教就用此曆法。此曆法被多數國家使用，被公認為公曆。

東正教教堂的建築式採拜占庭式，或斯拉夫式。天主教教堂採羅馬式或哥德式。而其內布置也各有不同，東正教堂聖壇中央掛有聖像，四周則掛聖徒畫像，而天主教堂聖壇中央掛聖母瑪利亞畫像，聖壇兩旁掛耶穌畫像，周圍牆上掛十四幅耶穌受難畫像。

東正教哲學主張上帝和世界的統一、上帝和人類和諧性、神性與人性結合、神學與哲學合一，反對理性，提倡神秘主義，通過神秘主義，使人吸取神的智慧，強調救世主如何變成有血有肉的軀體和如何降臨於人世的奧秘；天主教哲學主張理性，強調天主的啟示和人類的理性是一致的，反對神秘主義。東正教哲學提倡用神學和哲學的思維方式來建立真正的基督文明，貶低天主教，認為天主教不能發揚基督的博愛和自我犧牲精神，指責天主教把上帝和人類分離開來，因而不能建立真正的基督文明。